15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0234 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  44.71 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  40.12 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  38.37 
 
 
176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  37.2 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  35.4 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  33.14 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  33.53 
 
 
179 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  30.51 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  26.28 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  29.59 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  24.84 
 
 
147 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  24.24 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  25.16 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>