More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0217 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
323 aa  653    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  46.42 
 
 
324 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  43.81 
 
 
332 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  42.94 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  37.5 
 
 
385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  45.67 
 
 
131 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  47.58 
 
 
138 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  48.36 
 
 
140 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  49.18 
 
 
140 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.52 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 
214 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  32.45 
 
 
428 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  36.99 
 
 
189 aa  99  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  42.62 
 
 
151 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  33.52 
 
 
207 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.73 
 
 
145 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  38.51 
 
 
213 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  33.87 
 
 
144 aa  95.9  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  35.59 
 
 
222 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.33 
 
 
141 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
265 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  33.33 
 
 
231 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  33.33 
 
 
243 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
192 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  35.06 
 
 
210 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  34.34 
 
 
215 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
208 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
208 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  40.16 
 
 
151 aa  89.4  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.77 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  31.98 
 
 
188 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  31.76 
 
 
185 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.52 
 
 
143 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  34.34 
 
 
215 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.52 
 
 
143 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  34.68 
 
 
210 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  34.34 
 
 
215 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  34.34 
 
 
215 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  34.34 
 
 
215 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  33.73 
 
 
215 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  34.05 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  34.29 
 
 
127 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  36.75 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  28.98 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  32.31 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  33.9 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  33.52 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  33.88 
 
 
214 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  36.14 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  32.54 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  33.7 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  33.7 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  34.97 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  35.05 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  33.14 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  32.95 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  36.63 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  38.66 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  34.97 
 
 
218 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  33.13 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  29.89 
 
 
222 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  37.4 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  40.16 
 
 
153 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  34.97 
 
 
218 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  27.11 
 
 
214 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  36.2 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  36.2 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  36.43 
 
 
162 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.13 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  40.91 
 
 
153 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  36.72 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  36 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  32.95 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  28.09 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  36.13 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.39 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.48 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  32 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  33.53 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  36.36 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  31.43 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  32.95 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  29.26 
 
 
228 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  30.56 
 
 
210 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.59 
 
 
183 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 
222 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  32.5 
 
 
145 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  32.2 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  37.6 
 
 
150 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  30.46 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>