More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0199 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.42 
 
 
393 aa  665    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  82.7 
 
 
393 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  82.95 
 
 
393 aa  681    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
393 aa  807    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.68 
 
 
393 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  72.07 
 
 
399 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.92 
 
 
387 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  66.24 
 
 
388 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.38 
 
 
387 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.63 
 
 
387 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.39 
 
 
387 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  65.39 
 
 
387 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.87 
 
 
387 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.38 
 
 
387 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.34 
 
 
387 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  65.14 
 
 
387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  63.52 
 
 
388 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  63.68 
 
 
390 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  63.17 
 
 
390 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  62.66 
 
 
390 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  63.02 
 
 
637 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  61.32 
 
 
490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  59.38 
 
 
381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  61.32 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  61.32 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  59.64 
 
 
382 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  59.64 
 
 
382 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  57.73 
 
 
382 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  59.54 
 
 
382 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  57.99 
 
 
382 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
382 aa  448  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  58.22 
 
 
383 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.76 
 
 
382 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.11 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.44 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.7 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  56.19 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  56.19 
 
 
382 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.22 
 
 
383 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
382 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.47 
 
 
382 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
383 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.73 
 
 
382 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.47 
 
 
387 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  58.76 
 
 
382 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  57.29 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  57.55 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
383 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  57.03 
 
 
383 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  54.71 
 
 
389 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 
382 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.51 
 
 
382 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 
382 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 
382 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.44 
 
 
389 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  58.25 
 
 
382 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.19 
 
 
382 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 
382 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
382 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.99 
 
 
382 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.25 
 
 
382 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.73 
 
 
382 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.44 
 
 
382 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  55.73 
 
 
383 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  54.76 
 
 
385 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.31 
 
 
383 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  54.5 
 
 
385 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  53.49 
 
 
383 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.65 
 
 
384 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  56.3 
 
 
358 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1336  1,3-propanediol dehydrogenase  49.1 
 
 
390 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
383 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.9 
 
 
383 aa  375  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 
383 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.39 
 
 
383 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0030  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.03 
 
 
390 aa  354  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.52 
 
 
382 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.83 
 
 
383 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  47 
 
 
382 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
388 aa  338  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2961  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.86 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.813406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 
410 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  44.85 
 
 
382 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2276  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.39 
 
 
388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.751184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  45.36 
 
 
382 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  45.36 
 
 
382 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  45.36 
 
 
382 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2389  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.91 
 
 
382 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00204044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  45.1 
 
 
382 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2726  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
385 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  45.1 
 
 
382 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
384 aa  316  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>