More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0172 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  100 
 
 		 465 aa  960    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.84 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  53.53 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  49.59 
 
 		 470 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  43.9 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  47.29 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  44.54 
 
 		 523 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36.94 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.99 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.53 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.84 
 
 		 475 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.76 
 
 		 517 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35.11 
 
 		 447 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.54 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.07 
 
 		 473 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  41.81 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.92 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.56 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.41 
 
 		 741 aa  252  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.05 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40.11 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  36.41 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  36.41 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  32.52 
 
 		 470 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  37.43 
 
 		 437 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.07 
 
 		 498 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.87 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  38.62 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.97 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  38.62 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  38.62 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.29 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  37.7 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.24 
 
 		 470 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  34.72 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  38.68 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.78 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  37.78 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  39.09 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  36.51 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  36.68 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.24 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.94 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  32.56 
 
 		 441 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  38.08 
 
 		 439 aa  229  7e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  32.68 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.26 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.75 
 
 		 491 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.4 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.22 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.09 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.14 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.6 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.63 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  32.98 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  35.73 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.66 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.67 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.67 
 
 		 468 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  34.37 
 
 		 482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.36 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.57 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.37 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.67 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  39.34 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.82 
 
 		 466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.97 
 
 		 491 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  36.19 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  36.31 
 
 		 460 aa  213  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.06 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.18 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.94 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.06 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  41.54 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  43.43 
 
 		 464 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  42.07 
 
 		 380 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.95 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.95 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.39 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.04 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  32.2 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  39.58 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  37.77 
 
 		 453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.33 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  33.76 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  35.45 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  36.07 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  36.63 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  36.3 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  33.25 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.27 
 
 		 569 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  32.43 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  33.05 
 
 		 386 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  30.53 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  31.89 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  32.4 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  32.06 
 
 		 390 aa  177  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  41.55 
 
 		 695 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  38.17 
 
 		 665 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.22 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>