167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0110 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  100 
 
 		 704 aa  1386    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  27.76 
 
 		 737 aa  198  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  27.26 
 
 		 688 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  26.34 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  27.27 
 
 		 657 aa  173  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  26.72 
 
 		 688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.41 
 
 		 632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  25.36 
 
 		 678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  23.38 
 
 		 667 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  26.12 
 
 		 691 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  24.78 
 
 		 689 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  24.82 
 
 		 689 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  24.41 
 
 		 688 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  24.36 
 
 		 688 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  24.2 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  23.96 
 
 		 688 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  23.86 
 
 		 740 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  25.76 
 
 		 765 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  25.47 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.2 
 
 		 677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  23.25 
 
 		 649 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.18 
 
 		 656 aa  127  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  22.19 
 
 		 669 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  26.45 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  23.09 
 
 		 686 aa  125  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  23.09 
 
 		 686 aa  125  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.51 
 
 		 686 aa  125  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  23.09 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  23.09 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  23.09 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  23.09 
 
 		 686 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  25.08 
 
 		 680 aa  124  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  23.58 
 
 		 686 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  24.04 
 
 		 664 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.51 
 
 		 677 aa  122  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  25.47 
 
 		 759 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.25 
 
 		 607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  23.01 
 
 		 686 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  23.01 
 
 		 686 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  25.25 
 
 		 832 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  24.15 
 
 		 614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  23.01 
 
 		 686 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  22.87 
 
 		 686 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  22.73 
 
 		 686 aa  117  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  25.35 
 
 		 839 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  25.47 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  23.95 
 
 		 686 aa  116  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  24.04 
 
 		 670 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  26.22 
 
 		 895 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.11 
 
 		 669 aa  114  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  25.31 
 
 		 607 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  25.58 
 
 		 765 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  24.85 
 
 		 824 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  24.85 
 
 		 830 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  25.58 
 
 		 765 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  25.58 
 
 		 765 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  21.17 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  20.95 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.77 
 
 		 606 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.06 
 
 		 782 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  25.98 
 
 		 607 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  25.12 
 
 		 674 aa  107  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  23.79 
 
 		 764 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  23.23 
 
 		 810 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  23.85 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  23.64 
 
 		 765 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  21.98 
 
 		 710 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25 
 
 		 606 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  24.58 
 
 		 818 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25.31 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.23 
 
 		 606 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.32 
 
 		 606 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  24.67 
 
 		 699 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  23.82 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.07 
 
 		 606 aa  99  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  23.98 
 
 		 745 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.18 
 
 		 740 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.94 
 
 		 612 aa  97.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.58 
 
 		 741 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  26.6 
 
 		 295 aa  97.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  21.55 
 
 		 791 aa  94.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  22.77 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  24.84 
 
 		 748 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.82 
 
 		 709 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  22.18 
 
 		 762 aa  91.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  24.92 
 
 		 748 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.63 
 
 		 695 aa  90.9  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.96 
 
 		 748 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.68 
 
 		 606 aa  89.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.99 
 
 		 608 aa  89.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  30.67 
 
 		 609 aa  88.6  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  21.78 
 
 		 697 aa  88.2  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.59 
 
 		 741 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.63 
 
 		 1077 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  24.11 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>