56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0099 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0099  dual specificity protein phosphatase  100 
 
 
370 aa  769    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1987  dual specificity protein phosphatase  47.59 
 
 
346 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0605  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  40.21 
 
 
419 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2186  dual specificity protein phosphatase  44.1 
 
 
500 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2732  dual specificity protein phosphatase  33.06 
 
 
369 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  28 
 
 
233 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0558  dual specificity protein phosphatase  27.61 
 
 
162 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0112118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0105  hypothetical protein  27.27 
 
 
227 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  31.34 
 
 
560 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  31.62 
 
 
550 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  33.61 
 
 
565 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  31.4 
 
 
565 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3774  hypothetical protein  29.71 
 
 
223 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  25.81 
 
 
169 aa  59.3  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  32.79 
 
 
565 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  29.91 
 
 
552 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1365  dual specificity protein phosphatase  28.7 
 
 
147 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.16 
 
 
563 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  30.41 
 
 
222 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  30.16 
 
 
563 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  30.16 
 
 
568 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.16 
 
 
563 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2119  hypothetical protein  27.59 
 
 
222 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  31.18 
 
 
545 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  32.18 
 
 
547 aa  52.8  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0241  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.577318  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2197  hypothetical protein  30.71 
 
 
207 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0888  protein of unknown function UPF0153  27.48 
 
 
223 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3611  dual specificity protein phosphatase  30.28 
 
 
152 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1088  dual specificity protein phosphatase  29.17 
 
 
191 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0371851  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  31.18 
 
 
581 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3916  Dual specificity protein phosphatase  28.87 
 
 
197 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1595  ABC transporter related  30.09 
 
 
507 aa  49.7  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1926  phosphatase family protein, putative  26.28 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1461  dual specificity protein phosphatase  28.37 
 
 
156 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0083  protein of unknown function UPF0153  23.36 
 
 
197 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161908  hitchhiker  0.00302678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  24.46 
 
 
232 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1120  protein tyrosine phosphatase / dual specificity protein phosphatase  27.27 
 
 
189 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2327  hypothetical protein  27.27 
 
 
229 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544606  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43165  predicted protein  24.54 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  27.47 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  27.27 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4369  dual specificity protein phosphatase  30.77 
 
 
162 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1905  hypothetical protein  27.59 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0344299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  28.33 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1893  protein of unknown function UPF0153  29.2 
 
 
229 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1383  dual specificity protein phosphatase  26.77 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  24.44 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3344  dual specificity protein phosphatase  29.73 
 
 
151 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  24.09 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1448  dual specificity protein phosphatase  37.74 
 
 
171 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1068  dual specificity protein phosphatase  23.91 
 
 
180 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0883  dual specificity protein phosphatase  26.43 
 
 
179 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  24.73 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1937  hypothetical protein  25.89 
 
 
225 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>