More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0098 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 		 811 aa  1660    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  38.95 
 
 		 828 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.25 
 
 		 861 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  36.13 
 
 		 859 aa  492  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  34.9 
 
 		 817 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.63 
 
 		 1037 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  31.28 
 
 		 893 aa  350  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  30.37 
 
 		 868 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  30.43 
 
 		 1062 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.51 
 
 		 830 aa  317  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  29.12 
 
 		 870 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  29.05 
 
 		 887 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  28.84 
 
 		 875 aa  307  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  30.81 
 
 		 871 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  29.94 
 
 		 877 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  30.97 
 
 		 868 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  28.89 
 
 		 819 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  29.27 
 
 		 884 aa  278  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  29.22 
 
 		 898 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  28.54 
 
 		 918 aa  272  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.8 
 
 		 853 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  28.17 
 
 		 853 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  28.76 
 
 		 923 aa  226  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  27.02 
 
 		 887 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  26.3 
 
 		 931 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  28.7 
 
 		 779 aa  162  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.61 
 
 		 869 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.78 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.33 
 
 		 758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  28.98 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  28.94 
 
 		 809 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  29.56 
 
 		 810 aa  147  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 		 761 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  28.6 
 
 		 757 aa  144  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  27.47 
 
 		 782 aa  144  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.08 
 
 		 810 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  25.75 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  27.9 
 
 		 769 aa  142  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  28.83 
 
 		 762 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  26.35 
 
 		 758 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  30.37 
 
 		 760 aa  140  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  26.09 
 
 		 758 aa  140  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  27.82 
 
 		 780 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.41 
 
 		 761 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 		 799 aa  137  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  25.99 
 
 		 758 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  28.02 
 
 		 781 aa  134  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  29.48 
 
 		 754 aa  134  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  25.81 
 
 		 790 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  26.94 
 
 		 792 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  26.94 
 
 		 791 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 		 764 aa  131  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 		 788 aa  131  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 		 791 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 		 791 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 		 791 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 		 791 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  28.9 
 
 		 790 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 		 796 aa  128  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 		 796 aa  128  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  26.07 
 
 		 794 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  26.65 
 
 		 791 aa  127  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  26.65 
 
 		 791 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  27.87 
 
 		 812 aa  126  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 790 aa  126  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  29.64 
 
 		 787 aa  126  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  28.67 
 
 		 795 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  26.75 
 
 		 795 aa  125  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  27.25 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  28.15 
 
 		 795 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  26.87 
 
 		 791 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  27.31 
 
 		 795 aa  124  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  25.92 
 
 		 794 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  25.92 
 
 		 794 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  27.49 
 
 		 803 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  29.62 
 
 		 765 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 		 794 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  26.45 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  26 
 
 		 795 aa  122  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  26.85 
 
 		 790 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 		 794 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  27.83 
 
 		 797 aa  120  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  27.9 
 
 		 795 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  27.43 
 
 		 809 aa  120  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0685  hypothetical protein  32.55 
 
 		 565 aa  120  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  29.25 
 
 		 779 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  28.37 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  28.1 
 
 		 799 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 		 801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 		 789 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 		 785 aa  119  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  27.05 
 
 		 791 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 		 789 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 		 789 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  25.9 
 
 		 789 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 		 796 aa  119  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  28.04 
 
 		 799 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  25.33 
 
 		 809 aa  118  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  27.7 
 
 		 801 aa  117  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>