More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0085 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 235 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  54 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  51.1 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  54.47 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  50.45 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  50.66 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  43.81 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  48 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  46.22 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  48.5 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  46.49 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  48.76 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  47.35 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  48.83 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  48.66 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  47.96 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  48.48 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  45.33 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  48.03 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  41.05 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  40 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.7 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  45.61 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  44.93 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  44.34 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  44.34 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  49.76 
 
 		 243 aa  184  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  46.86 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  47.09 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  44.49 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  49.1 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  39.19 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  44.9 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  45.41 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  50.49 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0478  hypothetical protein  45.81 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  37.4 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  44.14 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  38.26 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  42.6 
 
 		 226 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  44.69 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  38.3 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  45.33 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  44.95 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.39 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  46.08 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.83 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  46.15 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  46.15 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  45.18 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  43.05 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  44.29 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  42.79 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  41.15 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  36.55 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  42.36 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  45.5 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  40.34 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  42.73 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  41.2 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  45.59 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.33 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.71 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  40.17 
 
 		 269 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  43.44 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  44.64 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  41.6 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  39.39 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.15 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  41.74 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  40.34 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  43.89 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  43.98 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  43.18 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  40 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  39.44 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0832  alanine racemase domain-containing protein  39.82 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399806  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0138  hypothetical protein  39.82 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0131746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  39.73 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  46.23 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  48.53 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  44.3 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  43.36 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  43.54 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1996  hypothetical protein  38.94 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1991  hypothetical protein  38.6 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  37.1 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  42.44 
 
 		 222 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  40.55 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  38.77 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  40.89 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  42.72 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.53 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  44.44 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>