13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0070 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0070  cysteine-rich small domain protein  100 
 
 		 95 aa  200  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21220  cobalamin biosynthesis protein CbiD  50 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.982335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2979  cysteine-rich small domain protein  40.23 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3448  hypothetical protein  40.48 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4258  hypothetical protein  48.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3280  hypothetical protein  48.33 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2921  hypothetical protein  44.26 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181505  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3562  hypothetical protein  36.9 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.42106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1672  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0106952  hitchhiker  0.00000000163355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3547  hypothetical protein  42.62 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 498 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1186  hypothetical protein  45 
 
 		 111 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.75 
 
 		 341 aa  40  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>