264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0066 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  69.32 
 
 
179 aa  256  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  69.94 
 
 
199 aa  254  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0133  bacterioferritin  67.98 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  66.47 
 
 
179 aa  248  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  66.08 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  62.73 
 
 
169 aa  221  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1631  bacterioferritin  36.99 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000261591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  34.84 
 
 
160 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  32.92 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1277  bacterioferritin  38.78 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5032  bacterioferritin  33.99 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  36.72 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  34.51 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1332  bacterioferritin  33.55 
 
 
160 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  31.37 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  30.72 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0105  bacterioferritin  36.49 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  30.72 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  30.72 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.88 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  34.04 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  29.41 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  33.33 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0202  bacterioferritin  34.69 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.60302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  33.59 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  30.97 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  33.56 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  34.04 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  33.08 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  32.48 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  32.48 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  32.19 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  31.21 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  32.88 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  33.77 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  32.48 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  29.87 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1229  Ferritin Dps family protein  35.81 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  31.97 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  34.75 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11904  bacterioferritin bfrA  30.72 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.817982 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  32.48 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  31.85 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  31.08 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  32.48 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  30.26 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  33.1 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  33.33 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  31.29 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  33.1 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  33.1 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  31.29 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  31.21 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  31.91 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  33.1 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3758  bacterioferritin  32.89 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  33.33 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  31.91 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  33.1 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  33.1 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  31.72 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  32.89 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  31.21 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  29.93 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  31.82 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  31.82 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  30.41 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  32.06 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  31.29 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  31.91 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  32.58 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  31.91 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  31.25 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  30.26 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0706  bacterioferritin  30.97 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.95756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  31.51 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  31.06 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  30.34 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  30.5 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  29.25 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  29.29 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  29.08 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.5 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  29.08 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  31.72 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  31.08 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  30.77 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  29.79 
 
 
154 aa  60.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  34.35 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  32.82 
 
 
275 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>