More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0061 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  47.1 
 
 		 279 aa  271  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  46.01 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  42.36 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.69 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  34.66 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3248  rhodanese-like protein  34.08 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  51.28 
 
 		 124 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  51.28 
 
 		 124 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  46 
 
 		 129 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.83 
 
 		 189 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 113 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  47.44 
 
 		 127 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 		 127 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 		 127 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  44.87 
 
 		 127 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  51.32 
 
 		 189 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  26.77 
 
 		 342 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 129 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  46.84 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 		 130 aa  85.5  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  50 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  51.22 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  51.35 
 
 		 123 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  51.95 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  53.16 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  49.35 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  43.33 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  48.15 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  48.68 
 
 		 121 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.25 
 
 		 837 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  44.83 
 
 		 711 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  48.15 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  46.91 
 
 		 102 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  45.24 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  48.65 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 108 aa  80.5  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  40.22 
 
 		 377 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  45.33 
 
 		 476 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  48.1 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  49.32 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  49.32 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.75 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.75 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.05 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.75 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  44.58 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  46.75 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0736  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  48.65 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  46.75 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  46.43 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  48.65 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  46.75 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.78 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0670  NADH dehydrogenase  48.65 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.7 
 
 		 834 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  45.57 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  45.95 
 
 		 565 aa  75.5  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  48.65 
 
 		 554 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  48.65 
 
 		 554 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  48.65 
 
 		 554 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 142 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0828  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  48.65 
 
 		 554 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0919827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  43.42 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  40.66 
 
 		 100 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.95 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  41.56 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.67 
 
 		 938 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  29.7 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  40.43 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  40.74 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  46.67 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  44.59 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  43.42 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  44.16 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>