53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0055 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0055  sulphate transporter  100 
 
 
399 aa  769    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2855  sulfate permease (SulP)  51.15 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0352  sulfate permease (SulP)  36.17 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000117248  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2933  sulphate transporter  36.93 
 
 
440 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0271  sulphate transporter  35.86 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19270  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  39.18 
 
 
420 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0005122  normal  0.0184591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0676  MFS superfamily sulfate permease  33.85 
 
 
371 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0438  sulphate transporter  36.88 
 
 
386 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3514  sulphate transporter  36.88 
 
 
386 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.541769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3691  sulphate transporter  36.88 
 
 
386 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4150  transporter, putative  36.62 
 
 
424 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0481  sulphate transporter  38.24 
 
 
386 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3859  sulphate transporter  38.24 
 
 
386 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0536  sulphate transporter  36.36 
 
 
385 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0476  sulphate transporter  37.31 
 
 
386 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3181  transporter, putative  36.25 
 
 
373 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0457  sulphate transporter  37.89 
 
 
386 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2150  sulphate transporter  33.5 
 
 
379 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.471264  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0518  sulphate transporter  33.16 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.746729  normal  0.729706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4061  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.03 
 
 
393 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1883  sulphate transporter  35.37 
 
 
377 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1309  sulphate transporter  34.69 
 
 
374 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0598  sulphate transporter  34.12 
 
 
385 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0554  sulphate transporter  32.99 
 
 
382 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1994  sulphate transporter  33.42 
 
 
373 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0396646  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04645  sulfate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01740)  34.32 
 
 
349 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0508  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.08 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50753  SulP family transporter: sulfate  27.79 
 
 
475 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1670  benzoate membrane transport protein  33.88 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3042  sulphate transporter  34.35 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1280  sulphate transporter  33.92 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38899  predicted protein  36.17 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  24.75 
 
 
606 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1810  putative sulfate transporter  29.7 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0631  putative sulfate transporter  28.65 
 
 
527 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0710  sulphate transporter  28.99 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0792495  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14611  putative sulfate transporter  28.65 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.324968  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  25.29 
 
 
605 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0845  putative sulfate transporter  25.12 
 
 
523 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02670  hypothetical protein  26.14 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  25.15 
 
 
540 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2599  sulphate transporter  30.36 
 
 
532 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  29.71 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5067  sulfate permease  24.47 
 
 
496 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3664  sulphate transporter  29.41 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.189703 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5173  sulphate transporter  27.25 
 
 
426 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00867302  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  29.91 
 
 
520 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0104  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.4 
 
 
565 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  25.65 
 
 
558 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  26.36 
 
 
563 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1167  sulphate transporter  26.07 
 
 
496 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.422162  normal  0.0121281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  26.64 
 
 
580 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3748  sulphate transporter  27.03 
 
 
601 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>