More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0054 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  690    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  47.58 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  45.06 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  40.8 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  41.25 
 
 		 360 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  33.68 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  23.14 
 
 		 708 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2149  hypothetical protein  26.69 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.432183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  26.73 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  27.99 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  34.16 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  28.16 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  35.42 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.16 
 
 		 664 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.76 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  34.72 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.3 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0075  membrane protein-like protein  25.7 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986959  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0085  membrane protein-like protein  25.7 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0094  membrane protein-like protein  25.7 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  32.45 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  30.49 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.52 
 
 		 655 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  31.18 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.5 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  25.27 
 
 		 697 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  29.09 
 
 		 702 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.43 
 
 		 727 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  22.46 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  31.18 
 
 		 679 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  26.77 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.06 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0466  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.165029 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0466  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  28.89 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  28.89 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3723  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.98 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  26.27 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3536  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.58 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  28.89 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  23.51 
 
 		 715 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.63 
 
 		 699 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.4 
 
 		 670 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 659 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  30.19 
 
 		 700 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.66 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2682  fusaric acid resistance protein region  26.98 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  27.91 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  27.42 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  27.91 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  27.91 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  27.91 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  25.94 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.53 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  26.19 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  27.59 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.32 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03100  p-hydroxybenzoic acid efflux system component  24.25 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03051  hypothetical protein  24.25 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.19 
 
 		 745 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.4 
 
 		 743 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  32.03 
 
 		 695 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.89 
 
 		 720 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1212  hypothetical protein  30.14 
 
 		 731 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000149337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  26.39 
 
 		 718 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  31.71 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  25.14 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3677  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.75 
 
 		 655 aa  56.2  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  26.59 
 
 		 676 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  29.03 
 
 		 725 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  30 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.51 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  24.58 
 
 		 717 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.68 
 
 		 727 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  24.58 
 
 		 720 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  32.03 
 
 		 695 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  24.58 
 
 		 720 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  30.18 
 
 		 729 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  31.37 
 
 		 695 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  24.58 
 
 		 720 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  24.58 
 
 		 717 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  27.64 
 
 		 726 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  24.58 
 
 		 720 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  24.58 
 
 		 720 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  26.6 
 
 		 662 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  24.63 
 
 		 744 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  31.37 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.1 
 
 		 699 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  26.44 
 
 		 734 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  29.71 
 
 		 736 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  26.44 
 
 		 734 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>