More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0046 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0046  ribosomal protein L20  100 
 
 		 117 aa  233  8e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0710  50S ribosomal protein L20  76.07 
 
 		 117 aa  180  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000670695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2636  50S ribosomal protein L20  71.55 
 
 		 117 aa  169  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0643522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0981  50S ribosomal protein L20  67.52 
 
 		 117 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0960905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1615  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 		 118 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000423443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0487  50S ribosomal protein L20  70.8 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000568702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2170  ribosomal protein L20  65.52 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00052538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2398  ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0041866  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  68.75 
 
 		 118 aa  156  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2994  ribosomal protein L20  63.25 
 
 		 117 aa  156  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  66.38 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1313  50S ribosomal protein L20  68.75 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000242462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3041  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1756  50S ribosomal protein L20  64.35 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000228708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 119 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1206  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1381  ribosomal protein L20  62.93 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1414  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 117 aa  153  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000403686  normal  0.489901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  67.26 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  66.96 
 
 		 117 aa  153  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  66.37 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05610  ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2305  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00881657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1518  50S ribosomal protein L20  64.91 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0150794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0217  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000274969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1821  LSU ribosomal protein L20P  60.87 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00014178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  69.64 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0800  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  66.96 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  66.07 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  66.07 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  66.07 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1092  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2658  50S ribosomal protein L20  64.66 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000886061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  68.14 
 
 		 120 aa  150  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4404  50S ribosomal protein L20  61.21 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1421  50S ribosomal protein L20  62.07 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  65.22 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2625  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000948958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4688  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.35886e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4704  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000111354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4469  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4304  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.71931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4315  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000569694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4681  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000654651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4817  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4697  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0556  50S ribosomal protein L20  60.34 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000506915  hitchhiker  1.2511e-24 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  66.07 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  64.35 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  65.18 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 117 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1223  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 117 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000332435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  65.18 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  63.48 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  64.6 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3259  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000143022  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2058  50S ribosomal protein L20  64.29 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.524551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0347  50S ribosomal protein L20  62.83 
 
 		 118 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  143  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  62.61 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 119 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  68.27 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  61.74 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1342  ribosomal protein L20  61.95 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00397655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2802  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01386  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2317  50S ribosomal protein L20  63.39 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000405852  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1872  50S ribosomal protein L20  57.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000476313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  60.87 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  60 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>