More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0015 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  345  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  56.89 
 
 		 184 aa  203  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  53.61 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0013  peptide deformylase  60.24 
 
 		 169 aa  201  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  57.83 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  50.61 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  50.31 
 
 		 167 aa  177  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  55 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  55 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  47.62 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  55.77 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  49.39 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  49.39 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  51.81 
 
 		 173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  49.39 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  49.69 
 
 		 169 aa  163  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  43.83 
 
 		 171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  46.75 
 
 		 171 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  46.95 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  47.44 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  47.53 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  49.37 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  48.47 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  46.95 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  46.95 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  46.34 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  46.95 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  44.24 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.47 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  46.34 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  47.31 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  46.34 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  47.7 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  46.34 
 
 		 169 aa  157  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  47.17 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  46.91 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  47.17 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46.71 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  47.27 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  49.09 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  46.34 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.25 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  47.24 
 
 		 167 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  46.39 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  42.77 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  47.88 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  47.56 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  49.1 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  43.64 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  46.06 
 
 		 175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  46.95 
 
 		 191 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  46.39 
 
 		 185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  50.31 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  45.78 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  44.17 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  43.37 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  46.34 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  45.78 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  48.17 
 
 		 184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  46.99 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2142  peptide deformylase  46.63 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.644494 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2219  peptide deformylase  46.63 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.025374  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  46.34 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  45.45 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  46.01 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1795  peptide deformylase  47.24 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.591266  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2023  peptide deformylase  47.24 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000549527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2071  peptide deformylase  47.24 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.0359728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2315  peptide deformylase  47.24 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000721135  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  45.06 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2302  peptide deformylase  47.24 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0456744  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  45.73 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  46.34 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  47.56 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  45.73 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2530  peptide deformylase  46.91 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  47.2 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44.85 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  47.56 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  49.69 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  45.12 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2319  peptide deformylase  46.01 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000135964  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  44.97 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  46.34 
 
 		 177 aa  147  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  45.96 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  45.96 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>