180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0008 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0008  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3113  protein of unknown function DUF214  46.74 
 
 
290 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0115  cell division protein FtsX  40.41 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0023  hypothetical protein  37.54 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2033  protein of unknown function DUF214  39.39 
 
 
300 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  25.17 
 
 
316 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1774  cell division ABC transporter, permease protein FtsX, putative  26.09 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.032171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2411  hypothetical protein  26.22 
 
 
321 aa  89  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0464721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2995  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000062578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1288  protein of unknown function DUF214  26.54 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1675  cell division protein  29.3 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1933  hypothetical protein  28.21 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3072  hypothetical protein  21.99 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000809977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0297  putative cell division protein  22.34 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000570278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1922  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4977  hypothetical protein  20.75 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2906  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.12 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  25.69 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.12 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.12 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1859  cell division protein FtsX  21.99 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000215986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  21.12 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  21.12 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  21.12 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  21.12 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1546  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  21.12 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  26.64 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  26.64 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0292  cell division protein, putative  22.34 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000194286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  26.64 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2901  cell division protein FtsX  24.19 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3722  hypothetical protein  20 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1278  cell division protein FtsX  25.21 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  21.23 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1605  cell division protein FtsX  25.13 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.081685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09060  cell division protein  22.89 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0921919 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1995  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  normal  0.0157399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2751  cell division protein FtsX, putative  26.17 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2371  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111261  hitchhiker  0.0000736942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03714  cell division protein  35.45 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  26.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  20.69 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0472  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.840554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4586  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.331228  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5335  cell division protein FtsX  27.19 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420624  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2740  hypothetical protein  26.25 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13118  cell division protein ftsX  39.22 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2451  hypothetical protein  23.93 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000143098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4005  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 
301 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2477  cell division protein FtsX  40 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.680753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  26.38 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3965  protein of unknown function DUF214  21.66 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000721724  hitchhiker  0.00000000316711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3614  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  30.83 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  30.83 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  30.83 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0429  putative protein insertion permease FtsX  26.67 
 
 
344 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0711  hypothetical protein  27.63 
 
 
294 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3946  hypothetical protein  25.34 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00455123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0951  cell division protein FtsX  27.33 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  30.83 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  23.14 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1235  protein of unknown function DUF214  48 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.43736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0285  hypothetical protein  20.95 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2243  cell division protein  28.64 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.410507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3452  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  31.34 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3772  cell division protein FtsX  26.03 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000178624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3607  cell division protein FtsX  26.42 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00806007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  22.75 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0374  cell division protein FtsX  26.5 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  hitchhiker  0.00757237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3845  cell division protein FtsX  25.91 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000185349  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3970  cell division protein FtsX  26.03 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000192163  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3608  hypothetical protein  20.88 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2110  efflux ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1047  hypothetical protein  20 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0188433  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  23.28 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  23.28 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  23.28 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  23.28 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0488  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4293  hypothetical protein  25.91 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4092  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000420483  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0246  hypothetical protein  21.3 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.261285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0173  hypothetical protein  26.03 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000303587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3188  protein of unknown function DUF214  19.92 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4162  hypothetical protein  26.03 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000013492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4584  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  26.03 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  34.56 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3021  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2154  hypothetical protein  28.64 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.903191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3722  protein of unknown function DUF214  45.45 
 
 
303 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233251  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2595  hypothetical protein  39.47 
 
 
309 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  30 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2722  hypothetical protein  39.47 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  22.22 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>