188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_R0008 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  94.03 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  92.75 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  91.04 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  96 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  96 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  94.34 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  89.86 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0001  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383152  normal  0.0513953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  88 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  92.59 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000753452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0052  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  95.35 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0040  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0006  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0006  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26100  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01900  tRNA-Arg  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>