More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3306 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 77 aa  157  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  80 
 
 		 80 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  80 
 
 		 80 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  73.61 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  73.61 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  76.56 
 
 		 75 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  76.56 
 
 		 76 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  67.14 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  78.95 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  70.31 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  64.29 
 
 		 74 aa  104  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 74 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 76 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  68.75 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  66.15 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 76 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  64.62 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  67.19 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  53.25 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  62.5 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.26 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  67.21 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  51.95 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 133 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  57.81 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 84 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  56.25 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  59.09 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  49.35 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  58.46 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  56.94 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  48 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 87 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  51.47 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  56.92 
 
 		 87 aa  83.6  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 112 aa  83.6  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2131  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5367  ribosomal protein S18  50.77 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  45.95 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  48.65 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0560  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.152801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  51.56 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7041  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  53.85 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3093  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0103903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  48 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5912  ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  43.42 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6032  30S ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  46.67 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>