36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3304 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  100 
 
 
319 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4352  membrane protein-like protein  36.08 
 
 
319 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0131  membrane protein-like  30.79 
 
 
328 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0867832  normal  0.324559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  25.4 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  25.56 
 
 
312 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.747160000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2213  hypothetical protein  25.08 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4932  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0823915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  24.28 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2912  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185591  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  24.68 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  24.28 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  24.28 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  24.92 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  25.56 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2390  hypothetical protein  26.21 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000143216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2974  hypothetical protein  27.05 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.324632  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2652  hypothetical protein  27.19 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0372503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  24.6 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  25.39 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  25.32 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23330  predicted membrane protein  24.76 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000027962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  23.57 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  27.03 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2269  hypothetical protein  36.36 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2536  hypothetical protein  23.5 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000281952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  24.58 
 
 
314 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  25.08 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0891  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0917  hypothetical protein  27.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.285275  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  25.38 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3543  hypothetical protein  23.97 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  23.44 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139293  hitchhiker  0.000000000000178909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2679  hypothetical protein  26.47 
 
 
269 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  26.77 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  22.98 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>