More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3242 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  59.87 
 
 
299 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  54.52 
 
 
299 aa  374  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  57.86 
 
 
299 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
299 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  51.03 
 
 
299 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2320  ABC transporter related  37.71 
 
 
299 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000441475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  37.76 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
293 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
293 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 
293 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
293 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 
293 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 
293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  29.62 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.72 
 
 
293 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  30.33 
 
 
307 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  34.36 
 
 
268 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  31.08 
 
 
284 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.49 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  37.38 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  29.58 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  33.92 
 
 
286 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.61 
 
 
301 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0275  ABC transporter related  30.25 
 
 
304 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
297 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0645  ABC transporter related  29.33 
 
 
306 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.86 
 
 
293 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 
297 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  29.39 
 
 
313 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  29.39 
 
 
313 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  29.39 
 
 
313 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  28.67 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  33.18 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 
297 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2666  ABC transporter related  33.63 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04520  ABC transporter related  31.73 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  33.33 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  33.48 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  26.55 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  28.37 
 
 
297 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
297 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  28.37 
 
 
297 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  32.91 
 
 
299 aa  139  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 
297 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  29.82 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  32.56 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  28.37 
 
 
297 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  29.47 
 
 
293 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  33.33 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  34.93 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  33.95 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 
232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 
287 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  28.33 
 
 
304 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
290 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  34.42 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  30.85 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.62 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  32.73 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  28.67 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  28.86 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  31.51 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
308 aa  135  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  29.93 
 
 
287 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  32.05 
 
 
245 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2325  putative ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.806084  hitchhiker  0.00000385927 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1802  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.87 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.95 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0431  ABC transporter related  28.92 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  34.84 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  27.67 
 
 
341 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.58 
 
 
317 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
356 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  31.49 
 
 
287 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  28.42 
 
 
297 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  29.74 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  28.72 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  27.95 
 
 
292 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  31.49 
 
 
287 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  33.95 
 
 
340 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  28.67 
 
 
299 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  32.27 
 
 
287 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  31.05 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  32.09 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>