251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3222 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  66.46 
 
 		 158 aa  216  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  68.83 
 
 		 158 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  66.88 
 
 		 158 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  66.88 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  67.53 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  66.88 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  66.23 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  68.83 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  66.88 
 
 		 158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  66.88 
 
 		 158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  65.58 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  62.73 
 
 		 161 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  60.25 
 
 		 161 aa  197  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  58.86 
 
 		 158 aa  193  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  68.18 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  48.05 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  45.91 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  46.67 
 
 		 169 aa  148  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  47.71 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  46.41 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  43.62 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  44.74 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  44.81 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  43.54 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  39.87 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_002950  PG2028  ebsC protein  45.95 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  40.91 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  43.14 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  42.68 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  45.51 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  40.27 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  41.56 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  43.23 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  43.23 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  41.56 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  40.88 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  42.58 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  41.88 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  42.11 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.46 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  39.61 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3321  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  41.88 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  41.03 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3413  ybaK/ebsC protein  40.65 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0703981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  41.4 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  44.7 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3029  hypothetical protein  46.15 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  43.79 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  40.82 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  42.67 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  39.74 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  39.74 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  40.69 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1029  hypothetical protein  43.95 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3539  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1040  ybaK/ebsC protein  38.06 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0196148  hitchhiker  0.0000171099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2973  ybaK/ebsC protein  37.42 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  38.31 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0018  ybaK/ebsC protein  42.21 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  37.66 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  36.13 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  40.26 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0531  YbaK/EbsC protein  38.46 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.969939  normal  0.0653141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  37.5 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3346  ybaK/ebsC protein  42.58 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  41.01 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>