More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3205 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 265 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  49.79 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  49.79 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  49.37 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  49.37 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  49.37 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  49.37 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  49.37 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  49.37 
 
 		 257 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  49.37 
 
 		 255 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  42.68 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.5 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  42.5 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  42.08 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  40.83 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  40.83 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  40.83 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  40.83 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 		 222 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.53 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  35.17 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  34.19 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  34.19 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.19 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 		 282 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.76 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.74 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 		 252 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0467336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  35.22 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 		 245 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 244 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  32.53 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1643  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.6 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0353041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 		 238 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  30 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 		 259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0654  ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>