More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3192 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
399 aa  828    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  66.41 
 
 
401 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  64.34 
 
 
405 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  64.92 
 
 
404 aa  523  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  64.06 
 
 
402 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  61.86 
 
 
393 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  57.44 
 
 
391 aa  488  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  59.11 
 
 
387 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  58.73 
 
 
397 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  58.14 
 
 
390 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  59.06 
 
 
393 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  57.52 
 
 
387 aa  479  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  56.96 
 
 
390 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  58.49 
 
 
396 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  57.96 
 
 
398 aa  471  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  57.22 
 
 
396 aa  471  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  56.19 
 
 
396 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  57.7 
 
 
398 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  57.47 
 
 
396 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  57.47 
 
 
396 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  57.22 
 
 
396 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  58.03 
 
 
396 aa  472  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  56.96 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  56.96 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  56.7 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  56.96 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  56.96 
 
 
396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  57.48 
 
 
388 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  56.92 
 
 
398 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  55.15 
 
 
407 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  56.17 
 
 
392 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  55.91 
 
 
392 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  58.38 
 
 
386 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  59.17 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  55.15 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  56.07 
 
 
400 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  55.73 
 
 
387 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  56.61 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  56.46 
 
 
385 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  56.1 
 
 
391 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  55.38 
 
 
385 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  56.05 
 
 
386 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  54.87 
 
 
393 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  54.97 
 
 
388 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  54.24 
 
 
410 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  56.58 
 
 
385 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  53.52 
 
 
388 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  54.04 
 
 
395 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  54.35 
 
 
381 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  53.44 
 
 
386 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  54.74 
 
 
380 aa  408  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  52.38 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  53.58 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  51.3 
 
 
387 aa  398  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  42.45 
 
 
387 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  42.67 
 
 
387 aa  325  9e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  42.67 
 
 
387 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  42.67 
 
 
387 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  42.56 
 
 
385 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  42.67 
 
 
387 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  42.42 
 
 
387 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  42.42 
 
 
387 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  42.78 
 
 
387 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  42.42 
 
 
387 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  42.26 
 
 
387 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  39.12 
 
 
394 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  39.63 
 
 
398 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.95 
 
 
382 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  40.74 
 
 
399 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  42.47 
 
 
387 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  41.01 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  39.37 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  41.08 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  42.13 
 
 
402 aa  282  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  41.6 
 
 
394 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  37.08 
 
 
384 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  37.08 
 
 
384 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  41.33 
 
 
375 aa  279  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  38.73 
 
 
385 aa  276  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  40.38 
 
 
392 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.38 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  38.54 
 
 
395 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.33 
 
 
387 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  38.24 
 
 
391 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
379 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  38.17 
 
 
401 aa  272  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  41.76 
 
 
396 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  41.02 
 
 
400 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 
375 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  39.14 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 
395 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  40.43 
 
 
377 aa  270  4e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.76 
 
 
394 aa  270  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  39.57 
 
 
397 aa  269  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  40.72 
 
 
392 aa  269  7e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 
375 aa  269  8e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  38.87 
 
 
370 aa  269  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 
396 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 
395 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  38.66 
 
 
386 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>