More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3190 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 
432 aa  892  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  67.13 
 
 
432 aa  643  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  63.57 
 
 
431 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  65.8 
 
 
438 aa  594  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  63.43 
 
 
433 aa  589  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  61.4 
 
 
430 aa  582  1e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  2.41897e-05 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 
433 aa  575  1e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  61.34 
 
 
433 aa  574  1e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  60.65 
 
 
433 aa  568  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  60.88 
 
 
433 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  60.84 
 
 
433 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  59.44 
 
 
433 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  61.07 
 
 
433 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58285e-15 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  60.7 
 
 
436 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  1.90319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  59.3 
 
 
434 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  60.65 
 
 
432 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  59.21 
 
 
435 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  58.88 
 
 
434 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  58.24 
 
 
432 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  61.16 
 
 
433 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  56.28 
 
 
435 aa  528  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  58.24 
 
 
439 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  57.04 
 
 
433 aa  528  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  56.61 
 
 
433 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  58 
 
 
441 aa  528  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  56.74 
 
 
432 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 
433 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  56.94 
 
 
433 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  56.12 
 
 
437 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.25462e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  56.28 
 
 
432 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  56.51 
 
 
432 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 
432 aa  518  1e-146  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  56.07 
 
 
435 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  57.91 
 
 
432 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  55.81 
 
 
435 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  55.01 
 
 
433 aa  516  1e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  54.73 
 
 
434 aa  517  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  55.2 
 
 
434 aa  516  1e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  54.5 
 
 
434 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.65841e-12 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  53.94 
 
 
433 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  56.05 
 
 
434 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  53.12 
 
 
433 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  54.91 
 
 
433 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  55.48 
 
 
433 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 
434 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  54.19 
 
 
433 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  54.76 
 
 
433 aa  508  1e-142  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  53.13 
 
 
435 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  53.94 
 
 
432 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  52.66 
 
 
435 aa  492  1e-138  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  3.76262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  52.34 
 
 
436 aa  491  1e-138  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  54.42 
 
 
432 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  52.78 
 
 
433 aa  490  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  52.42 
 
 
434 aa  488  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  52.2 
 
 
457 aa  485  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  54 
 
 
443 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  53.61 
 
 
433 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  52.56 
 
 
434 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  53.26 
 
 
434 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 
439 aa  471  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  52.44 
 
 
444 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  52.53 
 
 
444 aa  469  1e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  52.73 
 
 
423 aa  471  1e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 
441 aa  468  1e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  51.89 
 
 
441 aa  469  1e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  51.97 
 
 
444 aa  468  1e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  52.07 
 
 
446 aa  471  1e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  52.84 
 
 
445 aa  465  1e-130  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0041  phenylacetate--CoA ligase  53.79 
 
 
446 aa  465  1e-130  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  53.02 
 
 
428 aa  465  1e-130  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  49.3 
 
 
439 aa  467  1e-130  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  51.89 
 
 
441 aa  468  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  48.6 
 
 
439 aa  466  1e-130  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  51.74 
 
 
437 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 
434 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  51.65 
 
 
441 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  53.72 
 
 
448 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  52.03 
 
 
444 aa  461  1e-128  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  52.21 
 
 
433 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 
431 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  49.65 
 
 
436 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  52.48 
 
 
441 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  51.77 
 
 
441 aa  452  1e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  51.04 
 
 
429 aa  454  1e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  51.64 
 
 
439 aa  454  1e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  52.22 
 
 
445 aa  452  1e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0038  phenylacetate-CoA ligase  52.25 
 
 
441 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.455543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  52.26 
 
 
436 aa  453  1e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  51.76 
 
 
443 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 
430 aa  449  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  50.7 
 
 
429 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  51.86 
 
 
434 aa  445  1e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  49.54 
 
 
437 aa  447  1e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  52.58 
 
 
433 aa  447  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  50.94 
 
 
423 aa  447  1e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  52.44 
 
 
436 aa  447  1e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  51.05 
 
 
444 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  50.23 
 
 
436 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  49.19 
 
 
435 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  50.92 
 
 
437 aa  441  1e-122  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>