More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3176 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.42 
 
 
284 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.01 
 
 
284 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.72 
 
 
284 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  67.96 
 
 
287 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.02 
 
 
286 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2175  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  66.32 
 
 
288 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2878  fructose-bisphosphate aldolase  61.48 
 
 
284 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000127011  hitchhiker  0.0000797391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.8 
 
 
283 aa  341  9e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  54.93 
 
 
284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.49 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.48 
 
 
323 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  49.84 
 
 
307 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  49.19 
 
 
316 aa  292  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  50.52 
 
 
287 aa  291  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  48.58 
 
 
283 aa  291  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  50.17 
 
 
285 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0609  fructose-bisphosphate aldolase  50.7 
 
 
284 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.65 
 
 
307 aa  288  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  50.87 
 
 
287 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  49.13 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  52.9 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  48.78 
 
 
285 aa  281  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  49.48 
 
 
286 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  48.44 
 
 
286 aa  280  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  48.78 
 
 
285 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  49.48 
 
 
286 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  48.43 
 
 
285 aa  279  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  48.78 
 
 
285 aa  278  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  48.22 
 
 
309 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.03 
 
 
309 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.03 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.03 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  47.9 
 
 
307 aa  271  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.38 
 
 
307 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  45.67 
 
 
305 aa  270  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.73 
 
 
307 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.62 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  46.45 
 
 
283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.36 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  44.52 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  44.52 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  44.52 
 
 
284 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  46.1 
 
 
284 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.75 
 
 
307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2962  tagatose-bisphosphate aldolase  44.96 
 
 
285 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  43.31 
 
 
284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2645  tagatose-bisphosphate aldolase  44.6 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  42.96 
 
 
284 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  42.96 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  42.96 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  42.96 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  42.96 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1918  ketose-bisphosphate aldolase  44.91 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  42.96 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  42.96 
 
 
284 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  42.77 
 
 
330 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  43.11 
 
 
286 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  43.77 
 
 
283 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  44.17 
 
 
330 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  44.17 
 
 
330 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  44.17 
 
 
330 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  44.17 
 
 
330 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2384  tagatose-bisphosphate aldolase  42.25 
 
 
284 aa  248  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  43.82 
 
 
284 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  42.76 
 
 
292 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  42.05 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  44.13 
 
 
281 aa  242  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  44.13 
 
 
281 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1276  ketose-bisphosphate aldolase  45.77 
 
 
281 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1967  ketose-bisphosphate aldolase  44 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0791296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.29 
 
 
354 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  44.38 
 
 
338 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.75 
 
 
344 aa  239  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.98 
 
 
354 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  44.21 
 
 
354 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.38 
 
 
354 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.98 
 
 
354 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.98 
 
 
354 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.68 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>