More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3173 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  100 
 
 
314 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  42.59 
 
 
320 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  41.99 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  38.93 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  33.77 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  36.89 
 
 
430 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  31.8 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.65 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  34.8 
 
 
284 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  38.24 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  32.32 
 
 
582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.8 
 
 
309 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.98 
 
 
452 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  31.97 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  40.11 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.25 
 
 
323 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.81 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  33.21 
 
 
446 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  32.85 
 
 
292 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  32.24 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  32.42 
 
 
324 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.12 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  48.91 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  34.8 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.08 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48.09 
 
 
824 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  33.46 
 
 
271 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.96 
 
 
379 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.41 
 
 
411 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  28.08 
 
 
482 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.33 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.51 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  33.21 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  33.47 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.14 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  28.92 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.83 
 
 
400 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  29.17 
 
 
448 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.64 
 
 
376 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  30.5 
 
 
394 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  30.45 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  43.62 
 
 
404 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.54 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.08 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  29.67 
 
 
602 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  28.36 
 
 
438 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.77 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.96 
 
 
375 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  44.35 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  44.35 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  33.47 
 
 
402 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.55 
 
 
305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.84 
 
 
469 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  27.83 
 
 
412 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.19 
 
 
379 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  34.52 
 
 
284 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  27.6 
 
 
417 aa  108  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.31 
 
 
404 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  29.21 
 
 
328 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  32.24 
 
 
346 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  43.55 
 
 
305 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  46.22 
 
 
445 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.77 
 
 
198 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  43.59 
 
 
394 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  47.15 
 
 
332 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  32.58 
 
 
349 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  44.62 
 
 
243 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  28.57 
 
 
360 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  41.41 
 
 
333 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  29.7 
 
 
468 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.5 
 
 
291 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.97 
 
 
198 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.86 
 
 
321 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.46 
 
 
304 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  26.49 
 
 
449 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  30.69 
 
 
468 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.06 
 
 
377 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.63 
 
 
268 aa  102  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  33.12 
 
 
305 aa  103  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  27.95 
 
 
427 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  30.99 
 
 
427 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.53 
 
 
314 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.12 
 
 
423 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  31.06 
 
 
293 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  41.48 
 
 
374 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  47.83 
 
 
269 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  26.76 
 
 
295 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  38.62 
 
 
541 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.86 
 
 
445 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  46.55 
 
 
727 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.55 
 
 
727 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  43.7 
 
 
299 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.38 
 
 
751 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  32.8 
 
 
262 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.08 
 
 
238 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  32.8 
 
 
262 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  36.82 
 
 
296 aa  99.4  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.09 
 
 
238 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.73 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  33.88 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>