More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3161 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
147 aa  306  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.69 
 
 
148 aa  235  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  72.22 
 
 
153 aa  235  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.67 
 
 
145 aa  226  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  70.07 
 
 
156 aa  219  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  67.88 
 
 
151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.88 
 
 
151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  67.15 
 
 
154 aa  214  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.5 
 
 
149 aa  213  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  68.61 
 
 
158 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.64 
 
 
155 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  65.03 
 
 
154 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.49 
 
 
155 aa  209  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.73 
 
 
155 aa  209  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66.2 
 
 
161 aa  208  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.83 
 
 
152 aa  207  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  66.91 
 
 
156 aa  207  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.64 
 
 
153 aa  206  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  63.38 
 
 
156 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.34 
 
 
158 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.56 
 
 
162 aa  202  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  62.86 
 
 
159 aa  201  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.96 
 
 
153 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  60.56 
 
 
156 aa  201  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.5 
 
 
176 aa  199  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.84 
 
 
154 aa  198  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.04 
 
 
182 aa  196  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  61.7 
 
 
155 aa  196  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  61.97 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  61.97 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.94 
 
 
144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.86 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.86 
 
 
157 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.45 
 
 
170 aa  183  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.04 
 
 
169 aa  183  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.04 
 
 
169 aa  183  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  59.71 
 
 
159 aa  183  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.9 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.56 
 
 
149 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.62 
 
 
169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  54.55 
 
 
157 aa  165  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  45.14 
 
 
173 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.25 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.25 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  48.25 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  45.83 
 
 
153 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
164 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.75 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  46.15 
 
 
165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  43.75 
 
 
187 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.75 
 
 
177 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.06 
 
 
174 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  45.77 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.36 
 
 
174 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  45.83 
 
 
341 aa  125  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.7 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131735  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.61 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.61 
 
 
200 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  48.03 
 
 
146 aa  123  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.2 
 
 
180 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.1 
 
 
153 aa  120  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.8 
 
 
185 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.37 
 
 
167 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.4 
 
 
179 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  43.75 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.03 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  44.93 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  43.15 
 
 
162 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  43.57 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  41.1 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  44.12 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.86 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  44.12 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  42.03 
 
 
185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  38.46 
 
 
273 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.85 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0189  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.03 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.31 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  41.3 
 
 
185 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.4 
 
 
194 aa  111  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  39.29 
 
 
185 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.66 
 
 
151 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  40.58 
 
 
185 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  40.88 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.19 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  37.5 
 
 
151 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
168 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.41 
 
 
148 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.54 
 
 
150 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.61 
 
 
145 aa  103  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  40.31 
 
 
160 aa  103  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0627  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40 
 
 
162 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>