20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3158 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3158  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  52 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  35.14 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  42.03 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2389  hypothetical protein  43.33 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  37.33 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  29.17 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0075  hypothetical protein  43.84 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3311  uncharacterized small membrane protein  45.24 
 
 
73 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000828544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  33.87 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2493  hypothetical protein  37.31 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000695861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2145  hypothetical protein  52.46 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  32.26 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3833  hypothetical protein  39.53 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000000983405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  29.51 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0531  hypothetical protein  38.89 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000162896  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_496  hypothetical protein  38.89 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000000569038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  31.08 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  35.21 
 
 
81 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>