237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3155 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
77 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  71.05 
 
 
79 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  63.16 
 
 
76 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  73.58 
 
 
77 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  52.24 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  53.85 
 
 
70 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  47.76 
 
 
70 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  49.28 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  52.31 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  47.44 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  48.65 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 
87 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  44.29 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  51.52 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  53.73 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  51.52 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4315  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0295154  hitchhiker  0.0000000000618272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  43.94 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000070467  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  49.23 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.33 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3757  F0F1 ATP synthase subunit C  47.76 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3649  F0F1 ATP synthase subunit C  47.76 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000588902  unclonable  0.00000652587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.61 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3310  F0F1 ATP synthase subunit C  45.59 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48515  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3735  F0F1 ATP synthase subunit C  47.22 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.246424  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0007  F0F1 ATP synthase subunit C  48.39 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.316069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4109  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000110329  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4467  F0F1 ATP synthase subunit C  50.85 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000500836  hitchhiker  0.00000000117641 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  50.85 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  40.85 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5126  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00154985  normal  0.574958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  48.28 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5418  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.000148826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5205  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158761  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73300  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.731054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>