136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3147 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  53.45 
 
 
317 aa  316  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  51.25 
 
 
322 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  46.96 
 
 
314 aa  298  9e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  43.87 
 
 
326 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.64 
 
 
347 aa  235  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.64 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  38.91 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  37.62 
 
 
319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  39.02 
 
 
339 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  38.72 
 
 
339 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  38.72 
 
 
339 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  38.41 
 
 
339 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  38.72 
 
 
339 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  38.41 
 
 
339 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  38.41 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  38.41 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  40.6 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  40.52 
 
 
337 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  39.76 
 
 
341 aa  208  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  40.6 
 
 
358 aa  202  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  37.59 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  41.55 
 
 
342 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  39.87 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  37.46 
 
 
343 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  39.21 
 
 
291 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  34.77 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  35.46 
 
 
340 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  34.42 
 
 
383 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.45 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  32.62 
 
 
369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  35.42 
 
 
463 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  34.04 
 
 
376 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  33.64 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  34.86 
 
 
391 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  33.33 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  34.01 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  33.82 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.79 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  33.82 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.77 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  32.63 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  33.21 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 
376 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  34.55 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  34.18 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  33.57 
 
 
384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  34.18 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  34.32 
 
 
363 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.88 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  32.28 
 
 
391 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  33.92 
 
 
386 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.34 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  30.8 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  31.56 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  33.45 
 
 
380 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  31.41 
 
 
526 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  32.23 
 
 
625 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  30.12 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  33.56 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  31.01 
 
 
397 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  31.71 
 
 
546 aa  123  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.37 
 
 
381 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.78 
 
 
508 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  33.44 
 
 
405 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2752  SpoIID/LytB domain protein  27.4 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.98 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  33.44 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  32.3 
 
 
326 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  33.1 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.72 
 
 
366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.91 
 
 
421 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  29.41 
 
 
381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  29.79 
 
 
432 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.99 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  29.04 
 
 
368 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0071  SpoIID/LytB domain protein  29.31 
 
 
336 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000124334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  30.07 
 
 
454 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  29.65 
 
 
708 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.75 
 
 
570 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.6 
 
 
450 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  26.97 
 
 
720 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  30.06 
 
 
568 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.8 
 
 
675 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  32.37 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  26.65 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  27 
 
 
563 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  30.8 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  28.09 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.51 
 
 
762 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  25.33 
 
 
833 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.5 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  28.98 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  28 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  30.94 
 
 
489 aa  67  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18501  putative amidase enhancer  27.69 
 
 
511 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  26.3 
 
 
517 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  25.37 
 
 
586 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  24.6 
 
 
517 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  59.52 
 
 
584 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>