13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3141 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3141  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  729    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  24.03 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2342  Outer membrane protein-like  24.04 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0045  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00077566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2120  outer membrane protein-like protein  25.29 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000810254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0134  hypothetical protein  22.02 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000263159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 1496 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  34.83 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.82 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  35.16 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.94 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 455 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 458 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>