More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3128 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 		 211 aa  424  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  40.1 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  44.44 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  37.93 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  37.93 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  37.25 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  34.95 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  33.5 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  36.95 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  38 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  36.68 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  35.12 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  30.35 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  34.54 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  35.24 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  33.8 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  38.81 
 
 		 365 aa  95.5  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  28.1 
 
 		 214 aa  94.7  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  34.3 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  30.48 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  31.88 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  29.72 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  30.84 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  30.1 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  35.89 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  37 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  30.1 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  31.66 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  34.93 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  30.59 
 
 		 229 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  26.96 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.92 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.05 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  35.62 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  32.84 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  28.1 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  33.54 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  30.05 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  30.7 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.37 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.3 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  33.18 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  26.54 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  29.33 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  33 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  25.37 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  30.23 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  24.5 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  30.77 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  28.25 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  31.93 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  29.27 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  31.93 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  31.86 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  29.01 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  29.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  27.69 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  27.69 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  30.58 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  27.46 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  28.51 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  30.07 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  29.72 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  30.66 
 
 		 269 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  31.52 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.58 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  29.95 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  29.9 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  31.19 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  31.21 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  27.27 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  27.27 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2356  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  26.83 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  26.21 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  29.11 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  29.11 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  30 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  30.34 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  26.48 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.08 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  29.52 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  29.52 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  29.05 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  29.05 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  29.05 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  29.05 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  29.05 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  26.7 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1764  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylateN- ac etyltransferase  32.81 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  28.97 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  27.36 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.86 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  26.11 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.150817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>