112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3125 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
165 aa  337  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
147 aa  264  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 
165 aa  262  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  46.75 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  46.75 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  53.05 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  52.44 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  47.92 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  42.76 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  42.48 
 
 
148 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  42.59 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  42.14 
 
 
163 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  42.14 
 
 
163 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
160 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
160 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 
163 aa  120  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 
163 aa  120  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  43.03 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  43.17 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  43.03 
 
 
166 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  43.03 
 
 
166 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 
160 aa  117  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  41.14 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  42.42 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  39.62 
 
 
193 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  44 
 
 
151 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  47.71 
 
 
111 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  36.75 
 
 
157 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  40.61 
 
 
163 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  40.61 
 
 
163 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  40.61 
 
 
163 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  40.61 
 
 
163 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  37.8 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  36.36 
 
 
145 aa  97.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  35.15 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  37.67 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  37.67 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  35.58 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  31.29 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  35.58 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  35.56 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  31.61 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  32.76 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>