54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3097 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3097  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
86 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4106  sporulation protein, YlmC/YmxH family  51.95 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2087  PRC-barrel domain-containing protein  55.26 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1292  sporulation protein, YlmC/YmxH family  42.68 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1312  sporulation protein, YlmC/YmxH family  41.25 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000153556  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1965  sporulation protein, YlmC/YmxH family  43.04 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0688  PRC-barrel domain-containing protein  43.42 
 
 
89 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0628  sporulation protein, YlmC/YmxH family  43.42 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4052  sporulation protein, YlmC/YmxH family  44.3 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000966355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3661  hypothetical protein  40.54 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2551  sporulation protein YlmC/YmxH  40.54 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000356426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1238  hypothetical protein  35.14 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144428  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3947  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000184665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0449  hypothetical protein  37.18 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000799213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1423  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.754196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4003  hypothetical protein  35.14 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000478598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4041  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000397229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1550  sporulation protein, YlmC/YmxH family  39.19 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000599646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3644  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000014803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3753  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3954  hypothetical protein  37.84 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1902  sporulation protein, YlmC/YmxH family  36.25 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09180  Sporulation protein YlmC/YmxH  40.51 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.50591e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1032  sporulation protein, YlmC/YmxH family  36.36 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3729  sporulation protein YlmC/YmxH  40 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000449353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1069  sporulation protein, YlmC/YmxH family  37.5 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000051036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0855  PRC-barrel  34.48 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102174  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1999  PRC-barrel domain-containing protein  34.62 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3916  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000126945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2060  sporulation protein, YlmC/YmxH family  35.06 
 
 
86 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0948  hypothetical protein  32.89 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000278649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0939  hypothetical protein  38.75 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0912  hypothetical protein  35.37 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1062  hypothetical protein  38.96 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000033681  hitchhiker  0.00140084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1650  sporulation protein, YlmC/YmxH family  38.96 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3174  sporulation protein, YlmC/YmxH family  34.88 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2726  YlmC/YmxH family sporulation protein  32.93 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000903378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1945  hypothetical protein  32.47 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3664  sporulation protein, YlmC/YmxH family  39.74 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000187641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1635  PRC-barrel domain-containing protein  34.18 
 
 
83 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2057  sporulation protein, YlmC/YmxH family  28.57 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3626  sporulation protein YlmC/YmxH  32.91 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.412892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1164  sporulation protein, YlmC/YmxH family  28.57 
 
 
79 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3851  hypothetical protein  29.76 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000302726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3842  hypothetical protein  30.95 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3815  hypothetical protein  30.38 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.14862e-63 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1731  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2013  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2456  hypothetical protein  30 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3941  hypothetical protein  30.38 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3563  hypothetical protein  30.38 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3545  hypothetical protein  30.38 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3655  hypothetical protein  30.38 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
563 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>