More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3062 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  100 
 
 
376 aa  771  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  62.37 
 
 
379 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  57.84 
 
 
382 aa  453  1e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  30.52 
 
 
399 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 
391 aa  179  5e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  27 
 
 
415 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 
376 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 
397 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
376 aa  141  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.43 
 
 
379 aa  136  7e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
370 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.76 
 
 
373 aa  122  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 
369 aa  121  2e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  29.75 
 
 
383 aa  120  4e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
383 aa  120  4e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  29.75 
 
 
383 aa  118  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
395 aa  119  1e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
376 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
375 aa  115  1e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  27.09 
 
 
378 aa  114  2e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.57 
 
 
376 aa  112  1e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25 
 
 
370 aa  112  1e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  7.27606e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  25 
 
 
376 aa  111  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  25.27 
 
 
369 aa  111  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.4 
 
 
376 aa  111  2e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 
382 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
376 aa  109  7e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 
376 aa  109  9e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 
383 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 
379 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 
381 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.4 
 
 
377 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
380 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 
381 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 
371 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.49 
 
 
377 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  24.8 
 
 
383 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 
381 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.32 
 
 
379 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  27.86 
 
 
381 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
378 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
369 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  25.07 
 
 
378 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 
377 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  23.21 
 
 
372 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  22.64 
 
 
405 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 
369 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  24.86 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  24.11 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 
371 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  25.07 
 
 
368 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  28.13 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 
780 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 
371 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.84 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25.07 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25.07 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25.07 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 
372 aa  96.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25.07 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  26.09 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
397 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 
377 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  24.84 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  24.93 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  22.7 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.93 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 
387 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.36 
 
 
376 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  25.57 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
368 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 
377 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 
388 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  23.63 
 
 
366 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 
364 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.88 
 
 
380 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.85 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  24.28 
 
 
375 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>