More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3039 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 308 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.65 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  31.7 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  29.07 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  31.05 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.02 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 310 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.05 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  27.08 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.47 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  28.98 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.76 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.15 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.34 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  26.17 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  26.76 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.92 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 801 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.27 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 584 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.09 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 746 aa  62.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.69 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 983 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.06 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 1035 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 1171 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>