125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3010 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  48 
 
 
293 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  36.24 
 
 
308 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  35.56 
 
 
325 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  31.01 
 
 
306 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  34.9 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  35.02 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  35.02 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  32.75 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  33.21 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  33.85 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  35.17 
 
 
298 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  33.72 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  33.46 
 
 
315 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  31.48 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  33.6 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  32.02 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  30.39 
 
 
296 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  35.29 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2429  hypothetical protein  33.21 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  32.27 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  30.8 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  33.47 
 
 
284 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  32.2 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  33.46 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  32.94 
 
 
288 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  29.22 
 
 
300 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  30.08 
 
 
284 aa  122  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  33.47 
 
 
287 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  29.37 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  29.35 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  29.67 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  29.76 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  30.33 
 
 
304 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2696  hypothetical protein  30.15 
 
 
291 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3119  hypothetical protein  78.69 
 
 
139 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2694  hypothetical protein  30.13 
 
 
293 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  25.6 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  28.57 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  34.1 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4555  hypothetical protein  34.68 
 
 
234 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.166025  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0230  hypothetical protein  31.01 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00383338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0300  hypothetical protein  29.01 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000400684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0397  hypothetical protein  28.9 
 
 
317 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  28.33 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  30.16 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  26.98 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2425  hypothetical protein  31.58 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  29.67 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2413  hypothetical protein  28.68 
 
 
326 aa  89.7  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000810744  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2432  hypothetical protein  29.67 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  26.24 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2607  hypothetical protein  31.13 
 
 
289 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.989258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  27.37 
 
 
298 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  26.59 
 
 
308 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2698  hypothetical protein  26.82 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  28.86 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  25.83 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  24.91 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  24.14 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  26.21 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  29.07 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  23.62 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  26.32 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  23.23 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  26.32 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  28.68 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  24.73 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  24.02 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  27.72 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  27.31 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  24.05 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  27.02 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0216  hypothetical protein  28.36 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000115501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1028  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  27.02 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2419  hypothetical protein  32.45 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2711  hypothetical protein  26.92 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0116861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  21.66 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1171  hypothetical protein  58.18 
 
 
96 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1032  hypothetical protein  28.68 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.15202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  25.88 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2771  hypothetical protein  28.79 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  26.14 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  23.75 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  39.39 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  23.45 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0679  hypothetical protein  43.84 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  25.67 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4961  hypothetical protein  32.99 
 
 
101 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0174  hypothetical protein  37.88 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.384261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  24.71 
 
 
401 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  24.71 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  23.95 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0677  hypothetical protein  41.89 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.260454 
 
 
-
 
NC_002978  WD0539  hypothetical protein  26.29 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0395  hypothetical protein  26.74 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  27.43 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>