255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2912 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
479 aa  954  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  56.16 
 
 
466 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  46.78 
 
 
481 aa  445  1e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  45.83 
 
 
479 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  44.17 
 
 
478 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  45.72 
 
 
477 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  47.93 
 
 
483 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  48.67 
 
 
476 aa  406  1e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  47.7 
 
 
494 aa  408  1e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  46.15 
 
 
482 aa  404  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  47.3 
 
 
481 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  43.01 
 
 
483 aa  400  1e-110  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  46.34 
 
 
482 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  44.82 
 
 
482 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  40.7 
 
 
482 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  46.46 
 
 
486 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.47661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  43.25 
 
 
483 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  42.95 
 
 
485 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  45.86 
 
 
491 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  40.16 
 
 
498 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  43.45 
 
 
481 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  40.74 
 
 
483 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  40 
 
 
481 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  42.69 
 
 
480 aa  353  5e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  40 
 
 
483 aa  352  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  42.89 
 
 
481 aa  351  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  38.22 
 
 
485 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  43.04 
 
 
481 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  39.71 
 
 
483 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  39.5 
 
 
479 aa  346  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  41.89 
 
 
483 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  38.64 
 
 
485 aa  345  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  40.5 
 
 
482 aa  343  3e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  39.49 
 
 
524 aa  342  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  41.34 
 
 
491 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  43 
 
 
478 aa  340  3e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  41.63 
 
 
485 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  41.63 
 
 
485 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  41.63 
 
 
485 aa  339  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  39.05 
 
 
485 aa  340  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.71372e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  40.08 
 
 
482 aa  338  1e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  41.42 
 
 
485 aa  338  1e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  41.76 
 
 
486 aa  338  2e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  40.25 
 
 
485 aa  337  4e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  41.02 
 
 
485 aa  337  4e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  40.82 
 
 
483 aa  336  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  41.33 
 
 
485 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  41.33 
 
 
485 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  41.33 
 
 
485 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  41.33 
 
 
485 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  37.19 
 
 
487 aa  333  3e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  43.84 
 
 
484 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  41.09 
 
 
485 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  40.73 
 
 
485 aa  328  2e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  40.86 
 
 
483 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  40.2 
 
 
488 aa  325  7e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  40.12 
 
 
485 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  40.82 
 
 
485 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  40.2 
 
 
485 aa  323  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  39.34 
 
 
485 aa  322  1e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  37.63 
 
 
485 aa  320  3e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.19 
 
 
488 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  40.17 
 
 
485 aa  315  1e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.36 
 
 
483 aa  313  3e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  39.43 
 
 
485 aa  313  6e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  40.62 
 
 
483 aa  312  8e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  40.62 
 
 
483 aa  312  8e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  40.62 
 
 
483 aa  312  8e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  40.62 
 
 
483 aa  312  8e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  40.62 
 
 
483 aa  312  8e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  40.9 
 
 
483 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  40.45 
 
 
483 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  40.7 
 
 
483 aa  310  3e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  40.98 
 
 
483 aa  310  3e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  37.94 
 
 
498 aa  310  3e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  40.53 
 
 
483 aa  310  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  38.84 
 
 
512 aa  308  2e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  308  2e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  37.07 
 
 
483 aa  306  4e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  39.84 
 
 
483 aa  306  5e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  39.79 
 
 
483 aa  306  5e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  39.79 
 
 
483 aa  306  5e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.59 
 
 
488 aa  306  8e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  38.77 
 
 
505 aa  305  2e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  38.93 
 
 
514 aa  303  4e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  36.05 
 
 
487 aa  302  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  41.34 
 
 
485 aa  300  5e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.34 
 
 
485 aa  299  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  41.03 
 
 
483 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  40.82 
 
 
483 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  40.82 
 
 
483 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  39.33 
 
 
486 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  39.02 
 
 
520 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 
486 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>