More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2893 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  49.34 
 
 
250 aa  221  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  47.44 
 
 
237 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  50.22 
 
 
238 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  45.85 
 
 
233 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  45.22 
 
 
238 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  40.26 
 
 
238 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  43.67 
 
 
231 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  40.08 
 
 
242 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  41.53 
 
 
241 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  41.01 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  41.99 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  38.99 
 
 
312 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  41.05 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  38.66 
 
 
256 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  38.98 
 
 
253 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  41.99 
 
 
230 aa  175  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  37.18 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  41.88 
 
 
602 aa  172  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  39.63 
 
 
250 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  41.28 
 
 
244 aa  170  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  40.65 
 
 
298 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  39.42 
 
 
245 aa  168  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  38.14 
 
 
247 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.67 
 
 
253 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  37.61 
 
 
237 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  39.25 
 
 
255 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  38.99 
 
 
241 aa  159  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  37.29 
 
 
233 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  36.67 
 
 
251 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  38.21 
 
 
238 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  37.39 
 
 
251 aa  153  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  40.09 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  40.66 
 
 
254 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  39.66 
 
 
236 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.04 
 
 
245 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  38.5 
 
 
264 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.9 
 
 
252 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  37.5 
 
 
250 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  37.77 
 
 
235 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  40.77 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  40.77 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  40.77 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  39.83 
 
 
242 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  36.82 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  37.97 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  35.09 
 
 
273 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  37.45 
 
 
272 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  37.5 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.24 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  35.47 
 
 
231 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  39.2 
 
 
260 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  38.86 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  39.38 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  37.97 
 
 
237 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  36.36 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  31.39 
 
 
240 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  37.56 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  37.56 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  37.66 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  38.26 
 
 
229 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  36.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  35 
 
 
237 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  34.71 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  35.39 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  33.58 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  37.16 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  34.8 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  37.5 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  32.62 
 
 
250 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  32.62 
 
 
250 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.25 
 
 
238 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  36.61 
 
 
255 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  30.47 
 
 
238 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  34.39 
 
 
264 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0121  peptidase C26  33.2 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  37.09 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  34.78 
 
 
239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  33.76 
 
 
222 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1237  peptidase C26  37.44 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  30.34 
 
 
259 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  32.87 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  35.41 
 
 
285 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  30.62 
 
 
277 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  29.84 
 
 
267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  30.58 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  34.23 
 
 
253 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  35.48 
 
 
229 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  36.7 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  33.02 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5760  peptidase C26  33.49 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  33.02 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  33.02 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  29.34 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  31.08 
 
 
244 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2749  peptidase C26  32.45 
 
 
262 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1099  peptidase C26  31.92 
 
 
243 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  30.45 
 
 
261 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  31.67 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  28.93 
 
 
253 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>