80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2883 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  67.83 
 
 
143 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  62.24 
 
 
143 aa  186  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  60.84 
 
 
143 aa  184  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.64 
 
 
143 aa  183  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  59.86 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.28 
 
 
170 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  58.74 
 
 
143 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  58.04 
 
 
143 aa  178  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.94 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  58.04 
 
 
143 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  58.04 
 
 
143 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  58.04 
 
 
143 aa  174  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  56.64 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.34 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.34 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  55.94 
 
 
143 aa  170  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  56.34 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  57.34 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  53.57 
 
 
143 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  58.74 
 
 
143 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  58.87 
 
 
143 aa  165  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  55.71 
 
 
142 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 
143 aa  164  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.35 
 
 
143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.52 
 
 
144 aa  148  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.15 
 
 
141 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
141 aa  134  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  48.59 
 
 
147 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  48.59 
 
 
147 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  47.01 
 
 
145 aa  133  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  49.65 
 
 
145 aa  131  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.93 
 
 
147 aa  130  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.86 
 
 
135 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  46.15 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  47.89 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.37 
 
 
144 aa  128  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  43.36 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  43.48 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 
143 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  39.86 
 
 
142 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.79 
 
 
143 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  39.72 
 
 
151 aa  114  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  43.65 
 
 
149 aa  113  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  46.46 
 
 
144 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  39.01 
 
 
142 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.46 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  39.84 
 
 
129 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  38.81 
 
 
144 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  39.84 
 
 
129 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  40.32 
 
 
129 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 
142 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  37.76 
 
 
142 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  35 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  35.21 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  31.58 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  38 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  37 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.28 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  35 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.83 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  32.74 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  24.06 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.89 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  25.93 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  27.48 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.43 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1570  ACT domain protein  32.32 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.409737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  36.17 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0896  amino acid-binding ACT domain protein  27.46 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  39.66 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  40.43 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  39.66 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.22 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>