198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2877 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  258  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  39.22 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  34.19 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  40.23 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40.7 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  45.78 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 268 aa  67  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  41.46 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  41.46 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  34.91 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  42.05 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.26 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.95 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  40.22 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  41.86 
 
 		 263 aa  62  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  39.78 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  28.83 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  32.11 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  31.87 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36.14 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  27.52 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  33.64 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  34.88 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  31.73 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  37.25 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  32.67 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  31.73 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  31.73 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  39.74 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  31.78 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  39.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0045  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  32.22 
 
 		 366 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  32.22 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.63 
 
 		 270 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 270 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  43.59 
 
 		 252 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  42.17 
 
 		 269 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  41.03 
 
 		 254 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  43.59 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  32.22 
 
 		 366 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  41.03 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.73 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.78 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.78 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.78 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  30.28 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  32.46 
 
 		 257 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.58 
 
 		 368 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 278 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  32.98 
 
 		 270 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 269 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  37.11 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0203  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  31.18 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.433996  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  31.11 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.21 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  43.84 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>