More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2859 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
291 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4179  Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase  27.86 
 
 
847 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
345 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
785 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  29.08 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.6 
 
 
1644 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.6 
 
 
1644 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.31 
 
 
2401 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.64 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
528 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.19 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.75 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 
1120 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.23 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
994 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  27.59 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
610 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
662 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  25.94 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
1077 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 
1334 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
1340 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  24.17 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 
1509 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
1435 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
684 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
857 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
652 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
632 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  26.09 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.27 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
509 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
1152 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
1152 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
513 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
996 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.84 
 
 
694 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
1115 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
635 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
653 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
1115 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
717 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
710 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
395 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>