239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2729 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  44.44 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  42.93 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  45.54 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  40.78 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  41.26 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  40.29 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  41.26 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.26 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  41.26 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.26 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  41.26 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  41.26 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  42.23 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  40.29 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  39.81 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  38.58 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  38.89 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  39.09 
 
 		 214 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  49.13 
 
 		 216 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  47.06 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  37.88 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  38.05 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  36.71 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  39.81 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  34.54 
 
 		 211 aa  128  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  37.17 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  35.07 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  36.65 
 
 		 192 aa  125  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  39.56 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  37.19 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  37.97 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  34.13 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  51.61 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00800  hypothetical protein  42.93 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  35.9 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  36.87 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  35.29 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  34.5 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.68 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  36.87 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  37.21 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  35.29 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  36.84 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  43.14 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.63 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.86 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  45.89 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  37.62 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.9 
 
 		 290 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  34.08 
 
 		 192 aa  116  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  34.34 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  32.68 
 
 		 245 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  34.55 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  32.51 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  34.44 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  32.62 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  34.38 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  33.67 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  45.08 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  33.51 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  35.37 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  35.47 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.51 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  35.84 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  35.26 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  35.64 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  34.04 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  38.15 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1849  protein of unknown function UPF0029  36.04 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  33.7 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  34.16 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  31.28 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.65 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  40.1 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  36.7 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  32.67 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1690  hypothetical protein  34.86 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  34.03 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  38.22 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  33.68 
 
 		 207 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1667  hypothetical protein  35.2 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.494886  normal  0.674111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  33.72 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  35.26 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  33.17 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1608  protein of unknown function UPF0029  41.67 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1820  hypothetical protein  38.71 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0596118  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  36.84 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  32.8 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  33.51 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>