More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2701 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
360 aa  729    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 
366 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.94 
 
 
370 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.66 
 
 
357 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.94 
 
 
379 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.22 
 
 
375 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.78 
 
 
362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.28 
 
 
358 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
399 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  37.54 
 
 
354 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  42.03 
 
 
361 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  41.23 
 
 
852 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
354 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  38.94 
 
 
864 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  32.87 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
356 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  37.29 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.16 
 
 
361 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  37.01 
 
 
364 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  32.31 
 
 
358 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  37.01 
 
 
364 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  36.72 
 
 
364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  36.72 
 
 
364 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  37.67 
 
 
366 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  37.33 
 
 
863 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.48 
 
 
351 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.2 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 
364 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  36.11 
 
 
863 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  34.71 
 
 
363 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  37.57 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  37.43 
 
 
368 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  30.98 
 
 
362 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  36.71 
 
 
367 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.75 
 
 
362 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.5 
 
 
498 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  31.25 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  34.12 
 
 
378 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.46 
 
 
364 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.97 
 
 
362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.22 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.44 
 
 
498 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
496 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
371 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.96 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.43 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.29 
 
 
371 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.96 
 
 
364 aa  173  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.34 
 
 
360 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  33.63 
 
 
346 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.78 
 
 
352 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.46 
 
 
332 aa  166  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.11 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  33.15 
 
 
858 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  31.51 
 
 
371 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 
334 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.03 
 
 
372 aa  159  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.99 
 
 
361 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  31.67 
 
 
360 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.55 
 
 
348 aa  155  9e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.46 
 
 
360 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
370 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  31.16 
 
 
339 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  32.96 
 
 
346 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.51 
 
 
357 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  30.46 
 
 
360 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  32.84 
 
 
340 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
386 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 
366 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.07 
 
 
374 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.05 
 
 
356 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  31.64 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  31.64 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  28.8 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  30.9 
 
 
331 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.81 
 
 
366 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  31.53 
 
 
349 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
370 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 
368 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  32.38 
 
 
332 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
342 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  32.12 
 
 
383 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
366 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.85 
 
 
357 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  28.02 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
371 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 
360 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  28.53 
 
 
361 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.89 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
362 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
386 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 
367 aa  136  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2525  histidinol-phosphate aminotransferase  28.03 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.017315  normal  0.722575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>