25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2695 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2695  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3630  dehydrogenase-like protein  56.54 
 
 		 312 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  0.352042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0475  hypothetical protein  58.19 
 
 		 299 aa  361  9e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1511  hypothetical protein  54.67 
 
 		 301 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.850305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0807  hypothetical protein  55.67 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00370253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00720  hypothetical protein  49.35 
 
 		 305 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000877673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0112  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  321  8e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000282861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0149  hypothetical protein  50.83 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0567257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0114  hypothetical protein  50 
 
 		 302 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0358289  hitchhiker  0.00078389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0587  hypothetical protein  46.67 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0873705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1830  hypothetical protein  50.33 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.290615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2025  hypothetical protein  48.36 
 
 		 299 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0375526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0492  hypothetical protein  44.82 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.36 
 
 		 685 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.36 
 
 		 685 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.69 
 
 		 691 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  32.05 
 
 		 681 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  27.94 
 
 		 728 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  27.94 
 
 		 728 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 707 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  28.01 
 
 		 684 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  25.24 
 
 		 710 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  26.4 
 
 		 720 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  26.47 
 
 		 707 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  23.25 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>