60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2671 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 665 aa  1384    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.39 
 
 		 660 aa  532  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.32 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0625  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  40.32 
 
 		 681 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.94 
 
 		 684 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.13 
 
 		 628 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2286  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.48 
 
 		 685 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.95 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4593  hypothetical protein  31.74 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.89 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3443  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.25 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1628  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0465  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267369  unclonable  0.000014976 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0237  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.218824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.18 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.15 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2241  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.8 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2285  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.33 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2730  putative phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphatase  25.19 
 
 		 744 aa  61.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204405  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0220  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.92 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000131562  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.01 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.64 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.17 
 
 		 964 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5113  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.62 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.271498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3061  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.85 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.73632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4591  hypothetical protein  29.45 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.57 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1166  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.26 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.284742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0982  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.56 
 
 		 445 aa  55.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.503939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1690  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.13 
 
 		 490 aa  54.7  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.11 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1107  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1125  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.05 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.93 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5256  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.51 
 
 		 530 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3043  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.29 
 
 		 541 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.78 
 
 		 602 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3337  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.53 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  25.08 
 
 		 437 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1968  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.67 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1202  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.69 
 
 		 447 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.225173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.08 
 
 		 437 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4307  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.52 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.66 
 
 		 437 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.75 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.33 
 
 		 496 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.75 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  26.92 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0906  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.26 
 
 		 449 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0766913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.08 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5938  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.66 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.75 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.75 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.75 
 
 		 437 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1510  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.76 
 
 		 424 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000184999  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4734  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.57 
 
 		 505 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2468  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.33 
 
 		 434 aa  44.3  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000403556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.74 
 
 		 321 aa  43.9  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0344  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.45 
 
 		 417 aa  43.9  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.828514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>