149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2657 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  413  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  49.02 
 
 
204 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  38.54 
 
 
206 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2627  Putitive phosphate transport regulator  40.3 
 
 
203 aa  155  5e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  39.51 
 
 
206 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  148  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  40.29 
 
 
205 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  1e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  1e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  37.86 
 
 
206 aa  147  1e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.50489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  41.75 
 
 
206 aa  146  2e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  37.38 
 
 
206 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  41.67 
 
 
205 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  38.35 
 
 
205 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  40.78 
 
 
205 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  38.42 
 
 
205 aa  140  1e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  37.86 
 
 
205 aa  140  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  36.1 
 
 
205 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  36.59 
 
 
205 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.82132e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  36.59 
 
 
205 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  35.44 
 
 
213 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  124  8e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  31.88 
 
 
207 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.63551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  36.27 
 
 
208 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  36.27 
 
 
208 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  34.31 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  34.31 
 
 
208 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  34.31 
 
 
208 aa  120  1e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  35.41 
 
 
213 aa  120  1e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  34.98 
 
 
215 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  35.47 
 
 
215 aa  118  5e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  117  1e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  37.06 
 
 
209 aa  115  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  34.52 
 
 
208 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 
207 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  36.45 
 
 
215 aa  115  4e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  33.65 
 
 
217 aa  115  4e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  33.33 
 
 
207 aa  115  4e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  36.45 
 
 
215 aa  115  4e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  34.8 
 
 
208 aa  115  4e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  34.65 
 
 
209 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.85 
 
 
209 aa  114  7e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  32.83 
 
 
214 aa  114  1e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  38.14 
 
 
209 aa  113  2e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  113  2e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  35.03 
 
 
209 aa  113  2e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  28.22 
 
 
206 aa  112  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  33.82 
 
 
208 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  33.99 
 
 
215 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  34.85 
 
 
209 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  34.31 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  36.95 
 
 
215 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  34.48 
 
 
215 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  33.16 
 
 
208 aa  110  1e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  34.52 
 
 
209 aa  110  1e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  34.52 
 
 
208 aa  110  1e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  34.48 
 
 
214 aa  109  2e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  32.18 
 
 
210 aa  110  2e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  110  2e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  34.52 
 
 
208 aa  110  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  31.68 
 
 
210 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  32.18 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  34 
 
 
209 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  30.69 
 
 
207 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  31.98 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 
212 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  32.66 
 
 
205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  31.68 
 
 
205 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  31.53 
 
 
215 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  30.2 
 
 
205 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  31.19 
 
 
205 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  33.73 
 
 
208 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  29.95 
 
 
205 aa  101  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  33 
 
 
215 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  28.78 
 
 
211 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  28.78 
 
 
211 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  28.78 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  31.43 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  29.8 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  28.37 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  31.5 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  30.2 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  28.5 
 
 
211 aa  95.5  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  31.63 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>