65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2569 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 95 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  45.26 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  47.73 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  44.44 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  38.89 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0349  branched-chain amino acid transport  53.68 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  41.11 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  37.93 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  41.76 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  45.68 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0923  branched-chain amino acid transport  41.11 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.327368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  40.66 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1851  hypothetical protein  38.37 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1773  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1723  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1552  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1563  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.574296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1600  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.532771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  48.86 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1599  branched-chain amino acid transport  37.08 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.817749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1796  hypothetical protein  37.08 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3601  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  51.11 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1742  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  36.78 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  35.29 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2596  branched-chain amino acid transport  34.88 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2542  hypothetical protein  27.47 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2539  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2529  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2695  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1392  branched-chain amino acid transport  38.2 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1720  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000179582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  38.6 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  37.65 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1458  branched-chain amino acid transport  33.72 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3140  branched-chain amino acid transport  32.43 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  30.11 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0011  hypothetical protein  23.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0011  hypothetical protein  23.26 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 106 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0460  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  30.53 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  35.82 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3236  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0069593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0120  branched-chain amino acid transport  30.34 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000282674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  31.03 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  44.19 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  28.26 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001439  hypothetical protein  39.06 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  35.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1189  putative branched-chain amino acid transport protein  35.94 
 
 		 106 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>