24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2566 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1149  hypothetical protein  55.79 
 
 		 101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00416139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2135  hypothetical protein  47.37 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4294  hypothetical protein  46.05 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871194  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1117  hypothetical protein  41.41 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1043  hypothetical protein  43.48 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0061  ABC-type transport system, permease component  45 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.43136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2185  putative cobalt transport protein  37.37 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00209489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0512  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  55 
 
 		 343 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.21192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0773  hypothetical protein  41.11 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0303299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0744  putative cobalt transport protein  41.11 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1352  hypothetical protein  48.28 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.688346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  40.96 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  50 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0993  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  41.67 
 
 		 344 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1007  hypothetical protein  36.67 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0447393  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.96 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.29 
 
 		 326 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1928  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.11 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1570  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.89 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0565  cobalt transport protein CbiN  33.65 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0089  cobalt transport protein CbiN  37.25 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1792  cobalt transport protein CbiN  34.88 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000072815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>