More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2564 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  52.01 
 
 
276 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.52 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.32 
 
 
278 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.96 
 
 
278 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.22 
 
 
281 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.52 
 
 
398 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  45.32 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.93 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
256 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.91 
 
 
284 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 
456 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 
264 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.53 
 
 
244 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
395 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.76 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.96 
 
 
440 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 
277 aa  211  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  46.19 
 
 
246 aa  211  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  47.2 
 
 
271 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 
252 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.09 
 
 
281 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 
277 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 
411 aa  208  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.18 
 
 
403 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
453 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
259 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
250 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 
541 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  42.25 
 
 
380 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.22 
 
 
310 aa  204  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47 
 
 
252 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 
249 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
250 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
246 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 
277 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  45.57 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  45.42 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  45 
 
 
255 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
285 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.85 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.76 
 
 
255 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
285 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
249 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
266 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.43 
 
 
286 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.79 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.49 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.21 
 
 
249 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.93 
 
 
271 aa  194  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.22 
 
 
279 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.21 
 
 
291 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.98 
 
 
252 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  40.91 
 
 
254 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  36.36 
 
 
283 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
278 aa  191  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  45.16 
 
 
247 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  45.16 
 
 
251 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  45.16 
 
 
247 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 
272 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.29 
 
 
278 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
284 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 
254 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
403 aa  189  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 
282 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
285 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  41.1 
 
 
282 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  40.25 
 
 
240 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
277 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 
243 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  40.25 
 
 
239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
274 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 
305 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
248 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  37.32 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  38.97 
 
 
273 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
255 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
568 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
271 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.49 
 
 
280 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  40.87 
 
 
283 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.74 
 
 
574 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  41.3 
 
 
272 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  39.47 
 
 
303 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>